在《小城良方》中，最令人痛心的场景并非刘铮亮在福建遭到医院拒收，而是他灰心失落地重返小西门，穿上白大褂再度坐回诊室，抬头却发现随时可能被批准的撤销文件。他改变了以前强硬的态度，开始主动与大家打招呼，表示希望努力工作改善关系。然而，龙冬冬对此心知肚明，刘铮亮的性格变化无法拯救小西门。一个即使是天才医生也无法打破的，仍是来自上层的行政命令。

在刘铮亮回来的时候，他不断进行手术，从无人敢接的脑疝手术到工人受伤的紧急处理。他接受了急诊科副主任的职务，但裁撤的理由却是无情的：人流外迁、财政赤字、周边医院的竞争。无论他如何努力，这些冷冰冰的事实依然无法通过一台漂亮的手术去反驳。

龙冬冬在政府推动的医疗改革中也不遗余力，一方面默许医生多接外快以维持士气，另一方面又狠批那些让患者花冤屈钱的行为。他最大的依赖就是刘铮亮，通过一张大海报展现“小西门有刘铮亮”来争取时间。然而这种做法只是延缓了命运，真正问题在于小西门自身规模有限，依靠名医无法支撑。

转机出现在一个偶然的瞬间。刘铮亮刚刚回到小西门，因一次险遭挟持却决定为那位逃犯施行手术。这个从深圳失去执照、带着恐惧回到家乡的人，竟然在小西门救了曾威胁他性命的逃犯。此事的传开使“小西门”这个名字不再仅因刘铮亮而响亮，而是因为这里有人愿意冒险拯救生命，让小西门在外界的关注中重现生机。

然而，舆论无法改变来袭的撤销文件。真正决定小西门命运的人是陈凯，他是卫生系统的主任，干预这场危机。他比龙冬冬更清楚，对于这样的卫生院而言，唯一的出路不是抗争，而是融入更大的医疗体系。通过收编与托管取代直接的裁撤，陈凯的做法让小西门从可能被关闭变为被接收。

龙冬冬无法想象这个解决方案，因为这意味着承认自己三十多年来的努力已到极限。他为小西门倾注了感情和时间，而陈凯则没有这些负担，只关注数据与资源的有效利用。

最终，接收小西门的是一家大型综合医院。托管建立后，小西门有了半年过渡期，成为大医院的院区，经营权和人员得以保留。龙冬冬在退役时，留下了领导权给刘铮亮，而后他则回归平静的生活。

年轻医生得到了更好的培训机会，曾经的同事们纷纷找到了新的路。刘铮亮坐在院长的位子上，虽然外界仍然相信是他拯救了小西门，但他深知，救助逃犯的手术只是延缓了被撤销的命运；龙冬冬的关系亦未能根本改变小西门的处境。